Uno dei filoni più interessanti degli shojo manga è quello horror e gotico, caratterizzato da storie cupe, poteri Esp, creature fantastiche, e contaminazioni con altre culture, prima fra tutte quella gotica europea.
Creato da Kaori Yuki, una delle mangaka più interessanti dello shojo horror contemporaneo, Angel Sanctuary è un manga in cui confluiscono letture bibliche, Apocalissi, angeli caduti e mille altre cose affascinanti.
Un altro shojo horror interessante è Il sigillo azzurro di Chie Shinohara, o, dalla Corea, Model, senza dimenticare Edgar e Allan Poe di Moto Hagio.